
Grafisk visualisering börjar bli en svensk exportgren, och senaste tillskottet är Lundaföretaget Qlucore.
Programmet Qlucore Omics Explorer har på några få år fått användare bland världens ledande läkemedelsföretag. Programmet kan på kort tid hitta och visa mönster i stora mängder genetiska data.

Skillnad på grupper. Varje boll är en leukemipatient. Programmet har hittat två kluster, dels blå, dels grön och gredelin. Till höger, i ”värmekameran”, kan man se gen för gen hur grupperna skiljer sig. Röd och grön färg visar hur mycket ett anlag för leukemi kommer till uttryck.
Pionjären på området grafisk visualisering är Spotfire, ett företag som den svenske forskaren Christopher Ahlberg grundade på sin doktorsavhandling. Han flyttade företaget till Boston för att få fotfäste på den amerikanska marknaden och sålde 2007 företaget till Tibco för ett niosiffrigt belopp.
Det nya med Spotfire var inte den grafiska visualiseringen som sådan – statisk grafik finns i vartenda kalkylark – utan att det var ett dynamiskt verktyg. När man har läst in en datamängd kan man sortera och filtrera i realtid och vända och vrida på variablerna. Christopher Ahlberg hade inte för inte studerat för Ben Shneiderman, som räknas som världens kanske ledande expert på användargränssnitt.
Ben Shneidermans mantra är överblick först, detaljer på begäran. Han vill att nyttan med ett grafiskt användargränssnitt ska vara mätbar och att det ska få användaren att känna sig kompetent och effektiv. Troligen har få av hans elever förverkligat det idealet bättre än Christopher Ahlberg, och dessutom lyckats sälja det i stor skala.
Nästa svensk på banan var Hans Rosling, professor på Karolinska.
Han hade ägnat decennier åt att studera och bekämpa sjukdomar i fattiga länder, men han hade också studerat statistik och efterlyste ett sätt att åskådliggöra statistik på ett bättre sätt än med tabeller och cirkeldiagram. Tillsammans med sonen Ola Rosling och sonhustrun Anna Rosling Rönnlund startade han företaget Gapminder och skapade programmet Trendalyzer.
Det gjorde Hans Rosling till en ”stand-up statistician” som inför en internationell publik åskådliggjorde fakta om fattigdomen i världen. Trendalyzer köptes 2007 av Google och finns för fri användning på Googles webbplats i lättviktsversionen Motion Chart.
Trendalyzer har uppenbarligen lånat idéer från Spotfire, men också tillfört egna, och kanske lite mer lekfullhet. Och lättviktsversionen är som sagt gratis.
Qlucore från Lund släppte sin första produkt 2007. Företaget har riktat in marknadsföringen på läkemedelsföretag, men programmet passar till all analys av stora datamängder, till exempel finansiella data.
– Vår mjukvara är tusen gånger snabbare än allt annat som finns, säger vd:n Carl-Johan Ivarsson.
Han sammanfattar programmets uppgift: att ta en datamängd med kanske 50 000 dimensioner, eller om man så vill variabler, och visa upp den i två eller möjligtvis tre dimensioner.
– Snabbheten är viktig. Det är som digital fotografering. Förr tog du en bild och lämnade in rullen för framkallning. Nästa dag fick du se bilden. Med en digitalkamera ser du bilden omedelbart. Du får omedelbar återkoppling och då kan du dra fördel av hjärnans snabbhet.
Qlucore är resultatet av mötet mellan Thoas Fioretos, professor i klinisk genetik i Lund, och Magnus Fontes, docent i matematik.
Thoas Fioretos hade en stor mängd genetiska data för en grupp med 132 leukemidrabbade barn. Han tyckte att hans och hans kollegors analys gick för långsamt och bad Magnus Fontes om hjälp. Fontes program, som senare blev Qlucore, bekräftade på ett par minuter vad Fioretos och hans kollegor hade ägnat månader att få fram.
Dessutom visade programmet att de 132 barnen kunde delas upp i två grupper som läkarna inte hade upptäckt. Indelningen var betydelsefull på ett tragiskt sätt: av de leukemisjuka barnen dog alla i den ena gruppen, medan alla barnen i den andra gruppen överlevde.
Carl-Johan Ivarsson förklarar att den medicinska forskningen förändrades radikalt för tio femton år sedan – forskningsunderlaget förändrades från små till mycket stora datamängder. Både många individer och stora datamängder från varje individ – hela arvsmassan kan ju analyseras. Utmaningen är att kunna ställa frågor till materialet och få svar så snabbt att man kan pröva och avfärda hypoteser.
– Vi har inga algoritmer som inte finns någon annanstans. Skillnaden ligger i hur vi paketerar dem, säger Carl-Johan Ivarsson.
Magnus Fontes och professor Johan Råde, en annan av företagets grundare, har sett till att ettorna och nollorna tar kortaste vägen mellan databas och bildskärm. Algoritmsnillenas kod gör också att programmet kan köras på en vanlig pc.
– Vi för tillbaka kraften till dem som förstår ämnet. En biolog kan göra analysen utan hjälp av en statistiker, säger Carl-Johan Ivarsson.



















































